Hämeen kesäyliopisto oppilaitosta ylläpitää Hämeen ammattikorkeakoulun tytäryhtiö HAMK Akatemia Oy. Tytäryhtiö toimii HAMK Oy:n hallituksen alaisuudessa ja sen toiminnasta vastaa HAMK Oy:n toimitusjohtaja Pertti Puusaari, https://www.hamk.fi/tietoa-hamkista/hallinto/.
Hämeen kesäyliopiston toiminnasta vastaavana rehtorina toimii Juha-Pekka Liljander.
Kanta-Hämeen 11 kuntaa osallistuvat kesäyliopiston rahoitukseen. Kunnat ovat nimenneet edustajansa vuosittain kokoontuvaan neuvottelukuntaan, joka seuraa kesäyliopiston toimintaa.
Edustajat:
Jarmo Pynnönen, Forssa
Markus Rantsi, Hattula
Joona Riihimäki, Hausjärvi
Katja Ojala, Humppila
Päivi Raukko, Hämeenlinna
Rita Kannisto, Janakkala
Outi Vesakoski, Jokioinen
Leila Ahlqvist, Loppi
Niina Bitter, Riihimäki
Pekka Lintonen, Tammela
Sari Airo, Ypäjä