Hämeen kesäyliopiston toiminta on siirretty 1.1.2020 alkaen Hämeen ammattikorkeakoulun perustamaan tytäryhtiöön (HAMK Akatemia Oy). Tytäryhtiö toimii HAMK Oy:n hallituksen alaisuudessa ja sen toiminnasta vastaa HAMK Oy:n toimitusjohtaja Pertti Puusaari, https://www.hamk.fi/tietoa-hamkista/hallinto/.
Hämeen kesäyliopisto toimii osana HAMKin jatkuvan oppimisen kokonaisuutta. Jatkuva oppiminen kuuluu HAMKissa vararehtori Heidi Ahokallio-Leppälän vastuualueeseen. HAMKin jatkuvan oppimisen organisaation johtajana ja Hämeen kesäyliopiston toiminnasta vastaavana rehtorina toimii Juha-Pekka Liljander.
Kanta-Hämeen 11 kuntaa osallistuvat kesäyliopiston rahoitukseen. Kunnat ovat nimenneet edustajansa vuosittain kokoontuvaan neuvottelukuntaan, joka seuraa kesäyliopiston toimintaa.
Neuvottelukunta:
Jarmo Pynnönen, Forssa
Markus Rantsi, Hattula
Joona Riihimäki, Hausjärvi
Katja Ojala, Humppila
Päivi Raukko, Hämeenlinna
Rita Kannisto, Janakkala
Outi Vesakoski, Jokioinen
Leila Ahlqvist, Loppi
Niina Bitter, Riihimäki
Pekka Lintonen, Tammela
Sari Airo, Ypäjä